安徽理工大學設有地球與環境學院、能源與安全學院、土木建筑學院、機械工程學院、電氣與信息工程學院、材料科學與工程學院、化學工程學院、計算機科學與工程學院、理學院、外國語學院、醫學院、經濟與管理學院、測繪學院、人文社會科學學院、繼續教育學院、思想政治理論課教學部、體育部等17個學院（部）。

安徽理工大學最好的專業機械設計制造及其自動化專業是安徽省卓越工程師教育培養計劃建設專業、省教改示范專業，具有礦山機電工程博士學位授予權和機械工程一級學科碩士學位授予權。本專業下設機械設計、機械制造、機械電子工程、礦山機械工程四個專業方向，培養具備機械工程與電子技術、計算機技術相結合的，能從事機械工程及其自動化領域內的設計制造、科技開發、應用研究、運營管理等方面工作的高級工程技術人才。

安徽理工大學最好的專業土木工程專業為安徽省本科教改示范專業和教育部高等學校第一類特色專業建設點。本專業具有土木工程一級學科博士點，具有博士、碩士和工程碩士學位授予權。其中，巖土與結構工程為安徽省重點學科。本專業培養學生掌握土木工程的基礎理論、基本知識和工程實踐的基本技能，獲得土木工程師的基本訓練，能從事土木工程設計、施工、管理等工作的高級技術人才。

安徽理工大學最好的專業自動化專業從1973年開始招生，依托文件來源學科中二級學科博士學位授予點1個、一級學科碩士學位授予點1個、工程碩士學位授予點2個，現擁有煤礦自動化研究所（原煤炭部批準），省級實驗教學示范中心等。

環境工程專業是安徽省高校省級本科人才培養基地，安徽省重點學科，現有環境工程博士點、環境工程博士后流動站、環境工程碩士點和環境科學碩士點。主要研究方向有：水污染控制、大氣污染控制、固體廢物處理與資源化、礦區生態環境、環境規劃管理與評價、環境化學、土壤污染與防治等，承擔有國際合作科研項目、國家級、省部級、地市級別以及其它橫向科研項目。

地質工程是安徽理工大學設立最早的學科之一，是國家級特色專業建設點、安徽省重點學科、安徽省本科教改示范專業。該專業由我國著名地質學家柴登榜教授于1955年創立，1979年起招收碩士研究生。中國煤炭學會礦井地質專業委員會掛靠該學科點。該學科專業2004年被確定為安徽理工大學重點學科，2005年獲博士學位授予權，現擁有礦產普查與勘探、地質工程、地球探測與信息技術3個二級學科碩士點。

安徽理工大學最好的專業安全工程專業依托安全科學與工程學科，該學科為安徽省重點學科，是我國首批安全科學與工程一級學科博士學位授權點，同時具有工程碩士和高校教師在職攻讀碩士學位授予權。依托該學科擁有省部共建教育部重點實驗室和安徽省重點實驗室，安徽省工程技術研究中心。礦業工程研究生培養基地獲首批安徽省產學研聯合培養研究生示范基地，批準設立礦業工程博士后科研流動站。

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